Dopo il declino della Grande Moravia nel 900, perché il Principe Rastislav aveva sottomesso il principato alla Chiesa d’Oriente, si costituì un nuovo Impero Carolingio Oriente che però divenne oggetto di controversie tra i membri dell'aristocrazia della Boemia: nel 929, Boleslao I il Crudele assassinò suo fratello, il duca Venceslao I di Boemia, perchè si era convertito al cattolicesimo romano, sostenuto dai missionari tedeschi.
Nello stesso anno il Re di Germania, Enrico I l’Uccellatore, portò il suo esercito a Praga per reprimere la ribellione contro l’Impero.
Nel 950, il duca Boleslao commise molte crudeltà verso i tedeschi nel suo feudo e nel 955 organizzò una secessione nell’esercito imperiale, nella battaglia di Lechfeld.
Nel 973 fu fondata la diocesi di Praga da Volfango, vescovo di Ratisbona. Il primo Vescovo di questa diocesi divenne monaco benedettino sassone Tietmaro di Merseburgo. Dopo la Boemia venne subordinata alla Diocesi di Magonza.
Nel 983, Adalberto, uno slavo che aveva fondato il monastero benedettino di S. Margherita in Brewnow, divenne successore di Tietmaro. Nel 997 Adalberto fu ucciso dai pagani vetero-prussiani.
Enrico II, che fu imperatore dal 1014 fino al 1024, scacciò il duca polacco (e poi re) Boleslao I di Polonia che aveva conquistato gran parte della Boemia, Moravia e Slesia.
La Boemia divenne dipendente dalla Germania ed i duchi di Boemia erano obbligati prendere parte alle guerre dell’Impero.
Un monaco del monastero benedettino di Altaich, Günter il Beato, divenne eremita nella foresta boema. La fondazione del monastero benedettino di Raigern risale a Günter.
Attraverso la foresta vergine furono costruite strade di collegamento tra la Boemia e la Baviera, incrementando gli scambi commerciali più importanti tra la Boemia e la Moravia. La più importante fra queste strade fu la “Goldener Steig” (Sentiero Dorato). Lungo questa strada, emerse una serie di nuove città, per lo più di etnia tedesca.
La città di Prachatice deve la sua fondazione e la sua prosperità nel 14° secolo al Sentiero Dorato.
Nel 1030, Bretislao I di Boemia unì Boemia e Moravia, dopo che quelle regioni erano passate sotto il controllo della Polonia. Entrambe le terre furono feudi del Sacro Romano Impero.
Nel 1038, il duca Bretislao conquistò altre parti della Polonia e tentò di separarsi dall’Impero.
Nel 1063, Vratislao II di Boemia fondò l’Arcidiocesi di Olomouc e nel 1085 fu incoronato a Magonza come Re di Boemia.
Nel 1142, il monastero di Strahov, fu fondato dai monaci premonstratensi dell’Abbazia di Steinfeld, in Germania.
Il “monaci bianchi” posero le basi più
importanti della missione tedesca in Boemia e Moravia. Nel 1117, la duchessa
Richsa invitò a Kladruby i monaci benedettini di Zwiefalten (in Württemberg).